Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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