Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NRF1Q16656 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NRF1Q16656 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NRF1Q16656 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NRF1Q16656 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NRF1Q16656 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NRF1Q16656 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NRF1Q16656 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NRF1Q16656 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NRF1Q16656 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NRF1Q16656 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NRF1Q16656 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NRF1Q16656 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NRF1Q16656 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NRF1Q16656 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NRF1Q16656 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NRF1Q16656 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NRF1Q16656 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NRF1Q16656 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NRF1Q16656 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NRF1Q16656 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NRF1Q16656 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NRF1Q16656 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NRF1Q16656 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NRF1Q16656 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NRF1Q16656 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NRF1Q16656 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NRF1Q16656 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NRF1Q16656 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NRF1Q16656 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NRF1Q16656 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NRF1Q16656 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NRF1Q16656 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NRF1Q16656 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NRF1Q16656 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NRF1Q16656 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NRF1Q16656 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NRF1Q16656 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NRF1Q16656 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NRF1Q16656 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NRF1Q16656 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NRF1Q16656 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NRF1Q16656 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NRF1Q16656 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NRF1Q16656 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NRF1Q16656 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NRF1Q16656 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NRF1Q16656 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NRF1Q16656 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NRF1Q16656 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NRF1Q16656 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NRF1Q16656 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NRF1Q16656 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NRF1Q16656 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NRF1Q16656 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NRF1Q16656 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NRF1Q16656 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NRF1Q16656 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NRF1Q16656 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NRF1Q16656 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NRF1Q16656 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NRF1Q16656 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NRF1Q16656 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NRF1Q16656 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NRF1Q16656 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NRF1Q16656 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NRF1Q16656 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
NRF1Q16656 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
NRF1Q16656 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
NRF1Q16656 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
NRF1Q16656 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
NRF1Q16656 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NRF1Q16656 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NRF1Q16656 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NRF1Q16656 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NRF1Q16656 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NRF1Q16656 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NRF1Q16656 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NRF1Q16656 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NRF1Q16656 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NRF1Q16656 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NRF1Q16656 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NRF1Q16656 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NRF1Q16656 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NRF1Q16656 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NRF1Q16656 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NRF1Q16656 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NRF1Q16656 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NRF1Q16656 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NRF1Q16656 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NRF1Q16656 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NRF1Q16656 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NRF1Q16656 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NRF1Q16656 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NRF1Q16656 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NRF1Q16656 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NRF1Q16656 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NRF1Q16656 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NRF1Q16656 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NRF1Q16656 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms