Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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