Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
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