Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TNXAQ16473 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms