Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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