Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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