Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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SYCP1Q15431 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
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SYCP1Q15431 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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SYCP1Q15431 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
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SYCP1Q15431 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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SYCP1Q15431 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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SYCP1Q15431 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
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SYCP1Q15431 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCP1Q15431 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
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