Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLD3Q15054 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLD3Q15054 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLD3Q15054 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLD3Q15054 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLD3Q15054 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
POLD3Q15054 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLD3Q15054 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLD3Q15054 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLD3Q15054 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLD3Q15054 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLD3Q15054 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLD3Q15054 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
POLD3Q15054 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLD3Q15054 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLD3Q15054 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLD3Q15054 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLD3Q15054 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLD3Q15054 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLD3Q15054 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLD3Q15054 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLD3Q15054 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLD3Q15054 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLD3Q15054 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLD3Q15054 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLD3Q15054 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLD3Q15054 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLD3Q15054 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLD3Q15054 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
POLD3Q15054 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLD3Q15054 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLD3Q15054 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLD3Q15054 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
POLD3Q15054 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLD3Q15054 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLD3Q15054 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLD3Q15054 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLD3Q15054 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLD3Q15054 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLD3Q15054 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLD3Q15054 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLD3Q15054 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
POLD3Q15054 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLD3Q15054 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLD3Q15054 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLD3Q15054 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLD3Q15054 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
POLD3Q15054 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLD3Q15054 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLD3Q15054 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLD3Q15054 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLD3Q15054 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLD3Q15054 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLD3Q15054 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLD3Q15054 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLD3Q15054 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLD3Q15054 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLD3Q15054 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLD3Q15054 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLD3Q15054 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLD3Q15054 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLD3Q15054 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLD3Q15054 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLD3Q15054 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLD3Q15054 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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