Protein–RNA interactions for Protein: Q13972

RASGRF1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF1Q13972 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RASGRF1Q13972 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms