Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HTR4Q13639 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms