Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PEX6Q13608 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
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