Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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FOXE3Q13461 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
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FOXE3Q13461 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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FOXE3Q13461 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
FOXE3Q13461 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
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FOXE3Q13461 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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FOXE3Q13461 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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FOXE3Q13461 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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FOXE3Q13461 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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FOXE3Q13461 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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