Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
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