Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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SKP2Q13309 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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SKP2Q13309 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
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SKP2Q13309 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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SKP2Q13309 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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SKP2Q13309 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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SKP2Q13309 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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SKP2Q13309 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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SKP2Q13309 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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