Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIGQ13278 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIGQ13278 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIGQ13278 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIGQ13278 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIGQ13278 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIGQ13278 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIGQ13278 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIGQ13278 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIGQ13278 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIGQ13278 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIGQ13278 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RIGQ13278 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIGQ13278 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIGQ13278 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIGQ13278 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIGQ13278 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIGQ13278 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIGQ13278 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
RIGQ13278 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RIGQ13278 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
RIGQ13278 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
RIGQ13278 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
RIGQ13278 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
RIGQ13278 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RIGQ13278 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
RIGQ13278 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
RIGQ13278 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RIGQ13278 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RIGQ13278 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RIGQ13278 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RIGQ13278 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RIGQ13278 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RIGQ13278 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RIGQ13278 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RIGQ13278 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RIGQ13278 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RIGQ13278 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RIGQ13278 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RIGQ13278 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RIGQ13278 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RIGQ13278 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RIGQ13278 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RIGQ13278 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RIGQ13278 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RIGQ13278 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RIGQ13278 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RIGQ13278 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RIGQ13278 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RIGQ13278 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RIGQ13278 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RIGQ13278 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RIGQ13278 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RIGQ13278 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RIGQ13278 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RIGQ13278 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RIGQ13278 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RIGQ13278 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RIGQ13278 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RIGQ13278 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RIGQ13278 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RIGQ13278 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RIGQ13278 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RIGQ13278 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RIGQ13278 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RIGQ13278 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RIGQ13278 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RIGQ13278 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RIGQ13278 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RIGQ13278 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RIGQ13278 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RIGQ13278 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RIGQ13278 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RIGQ13278 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RIGQ13278 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RIGQ13278 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RIGQ13278 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RIGQ13278 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RIGQ13278 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RIGQ13278 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RIGQ13278 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RIGQ13278 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RIGQ13278 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RIGQ13278 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RIGQ13278 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RIGQ13278 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RIGQ13278 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RIGQ13278 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RIGQ13278 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RIGQ13278 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RIGQ13278 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RIGQ13278 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RIGQ13278 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RIGQ13278 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RIGQ13278 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RIGQ13278 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RIGQ13278 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RIGQ13278 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RIGQ13278 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RIGQ13278 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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