Protein–RNA interactions for Protein: Q13094

LCP2, Lymphocyte cytosolic protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCP2Q13094 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LCP2Q13094 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LCP2Q13094 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LCP2Q13094 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LCP2Q13094 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LCP2Q13094 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LCP2Q13094 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
LCP2Q13094 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
LCP2Q13094 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LCP2Q13094 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LCP2Q13094 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LCP2Q13094 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LCP2Q13094 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LCP2Q13094 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LCP2Q13094 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LCP2Q13094 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LCP2Q13094 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LCP2Q13094 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LCP2Q13094 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LCP2Q13094 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LCP2Q13094 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LCP2Q13094 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LCP2Q13094 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LCP2Q13094 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LCP2Q13094 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LCP2Q13094 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LCP2Q13094 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LCP2Q13094 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LCP2Q13094 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LCP2Q13094 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LCP2Q13094 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LCP2Q13094 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LCP2Q13094 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LCP2Q13094 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LCP2Q13094 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LCP2Q13094 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LCP2Q13094 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LCP2Q13094 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LCP2Q13094 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LCP2Q13094 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LCP2Q13094 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LCP2Q13094 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LCP2Q13094 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LCP2Q13094 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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LCP2Q13094 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LCP2Q13094 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LCP2Q13094 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LCP2Q13094 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LCP2Q13094 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LCP2Q13094 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LCP2Q13094 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LCP2Q13094 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LCP2Q13094 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LCP2Q13094 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LCP2Q13094 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LCP2Q13094 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LCP2Q13094 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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LCP2Q13094 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LCP2Q13094 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LCP2Q13094 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
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LCP2Q13094 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LCP2Q13094 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LCP2Q13094 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LCP2Q13094 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
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LCP2Q13094 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LCP2Q13094 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LCP2Q13094 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LCP2Q13094 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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LCP2Q13094 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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LCP2Q13094 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LCP2Q13094 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LCP2Q13094 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LCP2Q13094 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LCP2Q13094 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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LCP2Q13094 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LCP2Q13094 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LCP2Q13094 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LCP2Q13094 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LCP2Q13094 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LCP2Q13094 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LCP2Q13094 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LCP2Q13094 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LCP2Q13094 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LCP2Q13094 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LCP2Q13094 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LCP2Q13094 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LCP2Q13094 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LCP2Q13094 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LCP2Q13094 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LCP2Q13094 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LCP2Q13094 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LCP2Q13094 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LCP2Q13094 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms