Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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