Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NFX1Q12986 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NFX1Q12986 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NFX1Q12986 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NFX1Q12986 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NFX1Q12986 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NFX1Q12986 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NFX1Q12986 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NFX1Q12986 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NFX1Q12986 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NFX1Q12986 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NFX1Q12986 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NFX1Q12986 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NFX1Q12986 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NFX1Q12986 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NFX1Q12986 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NFX1Q12986 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NFX1Q12986 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NFX1Q12986 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NFX1Q12986 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NFX1Q12986 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NFX1Q12986 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NFX1Q12986 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NFX1Q12986 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NFX1Q12986 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NFX1Q12986 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NFX1Q12986 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NFX1Q12986 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NFX1Q12986 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
NFX1Q12986 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
NFX1Q12986 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NFX1Q12986 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NFX1Q12986 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NFX1Q12986 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NFX1Q12986 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NFX1Q12986 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NFX1Q12986 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NFX1Q12986 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NFX1Q12986 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NFX1Q12986 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NFX1Q12986 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NFX1Q12986 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFX1Q12986 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFX1Q12986 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFX1Q12986 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFX1Q12986 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NFX1Q12986 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFX1Q12986 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFX1Q12986 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFX1Q12986 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFX1Q12986 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFX1Q12986 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFX1Q12986 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFX1Q12986 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFX1Q12986 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFX1Q12986 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFX1Q12986 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFX1Q12986 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFX1Q12986 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFX1Q12986 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFX1Q12986 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFX1Q12986 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFX1Q12986 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFX1Q12986 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFX1Q12986 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFX1Q12986 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFX1Q12986 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFX1Q12986 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFX1Q12986 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFX1Q12986 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFX1Q12986 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFX1Q12986 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NFX1Q12986 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFX1Q12986 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NFX1Q12986 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NFX1Q12986 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NFX1Q12986 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NFX1Q12986 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NFX1Q12986 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NFX1Q12986 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NFX1Q12986 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NFX1Q12986 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NFX1Q12986 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NFX1Q12986 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NFX1Q12986 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NFX1Q12986 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
NFX1Q12986 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
NFX1Q12986 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
NFX1Q12986 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NFX1Q12986 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NFX1Q12986 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NFX1Q12986 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
NFX1Q12986 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NFX1Q12986 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NFX1Q12986 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NFX1Q12986 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NFX1Q12986 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NFX1Q12986 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NFX1Q12986 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NFX1Q12986 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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