Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
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