Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COX10Q12887 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COX10Q12887 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COX10Q12887 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COX10Q12887 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COX10Q12887 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COX10Q12887 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COX10Q12887 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COX10Q12887 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COX10Q12887 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COX10Q12887 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COX10Q12887 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COX10Q12887 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COX10Q12887 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COX10Q12887 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COX10Q12887 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COX10Q12887 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COX10Q12887 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COX10Q12887 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COX10Q12887 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COX10Q12887 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COX10Q12887 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COX10Q12887 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COX10Q12887 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COX10Q12887 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COX10Q12887 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COX10Q12887 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
COX10Q12887 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COX10Q12887 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COX10Q12887 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COX10Q12887 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COX10Q12887 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COX10Q12887 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COX10Q12887 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COX10Q12887 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
COX10Q12887 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COX10Q12887 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COX10Q12887 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COX10Q12887 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COX10Q12887 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COX10Q12887 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COX10Q12887 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COX10Q12887 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COX10Q12887 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COX10Q12887 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COX10Q12887 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COX10Q12887 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COX10Q12887 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COX10Q12887 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COX10Q12887 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COX10Q12887 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COX10Q12887 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COX10Q12887 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COX10Q12887 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COX10Q12887 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COX10Q12887 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COX10Q12887 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COX10Q12887 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COX10Q12887 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COX10Q12887 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COX10Q12887 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COX10Q12887 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COX10Q12887 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COX10Q12887 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COX10Q12887 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COX10Q12887 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COX10Q12887 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COX10Q12887 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COX10Q12887 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COX10Q12887 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COX10Q12887 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COX10Q12887 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COX10Q12887 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COX10Q12887 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COX10Q12887 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COX10Q12887 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COX10Q12887 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COX10Q12887 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COX10Q12887 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COX10Q12887 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COX10Q12887 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COX10Q12887 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COX10Q12887 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COX10Q12887 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COX10Q12887 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COX10Q12887 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COX10Q12887 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COX10Q12887 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COX10Q12887 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COX10Q12887 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COX10Q12887 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COX10Q12887 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COX10Q12887 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COX10Q12887 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COX10Q12887 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COX10Q12887 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COX10Q12887 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COX10Q12887 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COX10Q12887 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
COX10Q12887 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms