Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXO1Q12778 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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