Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDG4

SCRN3, Secernin-3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCRN3Q0VDG4 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCRN3Q0VDG4 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms