Protein–RNA interactions for Protein: Q09FC8

ZNF415, Zinc finger protein 415, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF415Q09FC8 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF415Q09FC8 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms