Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms