Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPOCK1Q08629 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPOCK1Q08629 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPOCK1Q08629 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPOCK1Q08629 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPOCK1Q08629 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPOCK1Q08629 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SPOCK1Q08629 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SPOCK1Q08629 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPOCK1Q08629 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPOCK1Q08629 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPOCK1Q08629 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPOCK1Q08629 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPOCK1Q08629 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SPOCK1Q08629 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPOCK1Q08629 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPOCK1Q08629 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPOCK1Q08629 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPOCK1Q08629 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms