Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE4DQ08499 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms