Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDR1Q08345 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms