Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLEQ07864 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLEQ07864 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLEQ07864 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLEQ07864 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLEQ07864 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLEQ07864 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLEQ07864 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
POLEQ07864 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLEQ07864 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLEQ07864 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLEQ07864 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLEQ07864 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLEQ07864 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLEQ07864 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLEQ07864 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLEQ07864 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLEQ07864 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLEQ07864 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLEQ07864 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLEQ07864 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLEQ07864 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLEQ07864 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLEQ07864 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLEQ07864 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLEQ07864 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLEQ07864 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLEQ07864 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLEQ07864 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
POLEQ07864 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
POLEQ07864 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLEQ07864 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLEQ07864 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLEQ07864 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLEQ07864 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLEQ07864 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLEQ07864 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLEQ07864 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLEQ07864 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLEQ07864 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLEQ07864 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLEQ07864 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLEQ07864 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLEQ07864 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
POLEQ07864 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLEQ07864 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLEQ07864 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLEQ07864 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLEQ07864 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLEQ07864 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLEQ07864 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLEQ07864 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLEQ07864 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
POLEQ07864 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLEQ07864 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLEQ07864 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLEQ07864 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLEQ07864 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLEQ07864 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLEQ07864 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLEQ07864 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLEQ07864 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLEQ07864 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLEQ07864 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLEQ07864 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLEQ07864 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLEQ07864 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLEQ07864 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLEQ07864 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLEQ07864 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLEQ07864 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLEQ07864 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLEQ07864 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
POLEQ07864 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLEQ07864 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLEQ07864 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLEQ07864 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLEQ07864 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLEQ07864 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLEQ07864 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLEQ07864 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLEQ07864 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLEQ07864 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLEQ07864 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLEQ07864 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLEQ07864 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLEQ07864 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLEQ07864 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLEQ07864 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLEQ07864 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLEQ07864 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLEQ07864 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLEQ07864 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLEQ07864 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLEQ07864 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLEQ07864 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLEQ07864 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
POLEQ07864 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
POLEQ07864 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLEQ07864 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms