Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE4BQ07343 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms