Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LTBQ06643 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LTBQ06643 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LTBQ06643 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LTBQ06643 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LTBQ06643 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LTBQ06643 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LTBQ06643 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LTBQ06643 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LTBQ06643 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LTBQ06643 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LTBQ06643 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LTBQ06643 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LTBQ06643 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LTBQ06643 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LTBQ06643 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LTBQ06643 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LTBQ06643 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LTBQ06643 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LTBQ06643 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LTBQ06643 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LTBQ06643 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LTBQ06643 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LTBQ06643 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LTBQ06643 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LTBQ06643 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LTBQ06643 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LTBQ06643 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LTBQ06643 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LTBQ06643 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LTBQ06643 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LTBQ06643 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LTBQ06643 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LTBQ06643 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LTBQ06643 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LTBQ06643 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LTBQ06643 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LTBQ06643 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LTBQ06643 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LTBQ06643 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LTBQ06643 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LTBQ06643 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LTBQ06643 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LTBQ06643 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LTBQ06643 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LTBQ06643 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LTBQ06643 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LTBQ06643 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LTBQ06643 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LTBQ06643 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LTBQ06643 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LTBQ06643 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LTBQ06643 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LTBQ06643 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LTBQ06643 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LTBQ06643 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LTBQ06643 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LTBQ06643 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LTBQ06643 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LTBQ06643 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LTBQ06643 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LTBQ06643 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LTBQ06643 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LTBQ06643 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LTBQ06643 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LTBQ06643 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LTBQ06643 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LTBQ06643 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LTBQ06643 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LTBQ06643 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LTBQ06643 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LTBQ06643 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LTBQ06643 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LTBQ06643 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LTBQ06643 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LTBQ06643 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LTBQ06643 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LTBQ06643 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LTBQ06643 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LTBQ06643 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LTBQ06643 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LTBQ06643 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LTBQ06643 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LTBQ06643 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LTBQ06643 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LTBQ06643 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LTBQ06643 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LTBQ06643 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LTBQ06643 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LTBQ06643 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LTBQ06643 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LTBQ06643 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LTBQ06643 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LTBQ06643 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LTBQ06643 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LTBQ06643 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBQ06643 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBQ06643 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBQ06643 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LTBQ06643 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms