Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD51Q06609 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms