Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms