Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CALD1Q05682 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms