Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN12Q05209 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN12Q05209 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms