Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms