Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms