Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUCB1Q02818 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms