Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLOD1Q02809 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms