Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.3■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.29■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.28■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21.28■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC21.27■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.27■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.27■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.27■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms