Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
MC1RQ01726 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms