Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.8
CLTCQ00610 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms