Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VLDLRP98155 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VLDLRP98155 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VLDLRP98155 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VLDLRP98155 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VLDLRP98155 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
VLDLRP98155 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VLDLRP98155 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VLDLRP98155 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VLDLRP98155 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VLDLRP98155 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VLDLRP98155 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VLDLRP98155 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms