Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKOR1P84550 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKOR1P84550 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SKOR1P84550 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKOR1P84550 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKOR1P84550 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKOR1P84550 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SKOR1P84550 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SKOR1P84550 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKOR1P84550 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKOR1P84550 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKOR1P84550 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKOR1P84550 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKOR1P84550 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKOR1P84550 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKOR1P84550 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKOR1P84550 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms