Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HBBP68871 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HBBP68871 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HBBP68871 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HBBP68871 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HBBP68871 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HBBP68871 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HBBP68871 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HBBP68871 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HBBP68871 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HBBP68871 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HBBP68871 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HBBP68871 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HBBP68871 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HBBP68871 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HBBP68871 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HBBP68871 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HBBP68871 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HBBP68871 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HBBP68871 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HBBP68871 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HBBP68871 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HBBP68871 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HBBP68871 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HBBP68871 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HBBP68871 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HBBP68871 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HBBP68871 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HBBP68871 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HBBP68871 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HBBP68871 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HBBP68871 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HBBP68871 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HBBP68871 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HBBP68871 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HBBP68871 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HBBP68871 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HBBP68871 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HBBP68871 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HBBP68871 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HBBP68871 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HBBP68871 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HBBP68871 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HBBP68871 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HBBP68871 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HBBP68871 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HBBP68871 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HBBP68871 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HBBP68871 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HBBP68871 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HBBP68871 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HBBP68871 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HBBP68871 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HBBP68871 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HBBP68871 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HBBP68871 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HBBP68871 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HBBP68871 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HBBP68871 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HBBP68871 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HBBP68871 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HBBP68871 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HBBP68871 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HBBP68871 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HBBP68871 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HBBP68871 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HBBP68871 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HBBP68871 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HBBP68871 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HBBP68871 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HBBP68871 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HBBP68871 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HBBP68871 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HBBP68871 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HBBP68871 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HBBP68871 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HBBP68871 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HBBP68871 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HBBP68871 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HBBP68871 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HBBP68871 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HBBP68871 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HBBP68871 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HBBP68871 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HBBP68871 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HBBP68871 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HBBP68871 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HBBP68871 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HBBP68871 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HBBP68871 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HBBP68871 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HBBP68871 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HBBP68871 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HBBP68871 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HBBP68871 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HBBP68871 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HBBP68871 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HBBP68871 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HBBP68871 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HBBP68871 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms