Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms