Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP107P57740 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP107P57740 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP107P57740 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP107P57740 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP107P57740 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP107P57740 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP107P57740 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP107P57740 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP107P57740 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP107P57740 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP107P57740 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP107P57740 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP107P57740 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP107P57740 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP107P57740 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP107P57740 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP107P57740 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP107P57740 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP107P57740 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP107P57740 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP107P57740 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP107P57740 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP107P57740 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP107P57740 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP107P57740 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP107P57740 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP107P57740 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP107P57740 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP107P57740 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP107P57740 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP107P57740 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP107P57740 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP107P57740 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP107P57740 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP107P57740 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP107P57740 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP107P57740 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP107P57740 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP107P57740 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP107P57740 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP107P57740 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP107P57740 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP107P57740 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP107P57740 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP107P57740 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP107P57740 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP107P57740 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP107P57740 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP107P57740 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP107P57740 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP107P57740 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP107P57740 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP107P57740 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP107P57740 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP107P57740 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP107P57740 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP107P57740 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP107P57740 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP107P57740 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP107P57740 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP107P57740 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP107P57740 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP107P57740 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP107P57740 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP107P57740 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP107P57740 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP107P57740 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP107P57740 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP107P57740 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP107P57740 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP107P57740 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP107P57740 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP107P57740 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP107P57740 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP107P57740 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP107P57740 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP107P57740 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP107P57740 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP107P57740 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP107P57740 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP107P57740 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP107P57740 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP107P57740 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP107P57740 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP107P57740 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP107P57740 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP107P57740 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP107P57740 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP107P57740 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP107P57740 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP107P57740 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP107P57740 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP107P57740 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP107P57740 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP107P57740 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP107P57740 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP107P57740 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP107P57740 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP107P57740 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms