Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H2BFSP57053 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2BFSP57053 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2BFSP57053 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H2BFSP57053 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2BFSP57053 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H2BFSP57053 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H2BFSP57053 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2BFSP57053 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
H2BFSP57053 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2BFSP57053 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC15.06■□□□□ 0
H2BFSP57053 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
H2BFSP57053 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
H2BFSP57053 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H2BFSP57053 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2BFSP57053 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
H2BFSP57053 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
H2BFSP57053 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.06■□□□□ 0
H2BFSP57053 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
H2BFSP57053 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2BFSP57053 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
H2BFSP57053 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
H2BFSP57053 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2BFSP57053 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
H2BFSP57053 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
H2BFSP57053 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2BFSP57053 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2BFSP57053 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H2BFSP57053 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2BFSP57053 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2BFSP57053 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H2BFSP57053 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.05■□□□□ 0
H2BFSP57053 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
H2BFSP57053 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
H2BFSP57053 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2BFSP57053 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.05■□□□□ 0
H2BFSP57053 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2BFSP57053 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2BFSP57053 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
H2BFSP57053 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2BFSP57053 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2BFSP57053 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2BFSP57053 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2BFSP57053 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
H2BFSP57053 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC15.05■□□□□ -0
H2BFSP57053 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
H2BFSP57053 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
H2BFSP57053 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
H2BFSP57053 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
H2BFSP57053 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
H2BFSP57053 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC15.05■□□□□ -0
H2BFSP57053 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2BFSP57053 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2BFSP57053 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2BFSP57053 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
H2BFSP57053 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2BFSP57053 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
H2BFSP57053 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2BFSP57053 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.05■□□□□ -0
H2BFSP57053 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2BFSP57053 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
H2BFSP57053 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2BFSP57053 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
H2BFSP57053 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
H2BFSP57053 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2BFSP57053 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2BFSP57053 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2BFSP57053 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2BFSP57053 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
H2BFSP57053 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2BFSP57053 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2BFSP57053 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
H2BFSP57053 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
H2BFSP57053 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H2BFSP57053 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
H2BFSP57053 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2BFSP57053 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2BFSP57053 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2BFSP57053 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
H2BFSP57053 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H2BFSP57053 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2BFSP57053 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2BFSP57053 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2BFSP57053 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2BFSP57053 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2BFSP57053 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2BFSP57053 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
H2BFSP57053 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2BFSP57053 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2BFSP57053 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
H2BFSP57053 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H2BFSP57053 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
H2BFSP57053 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
H2BFSP57053 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2BFSP57053 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
H2BFSP57053 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2BFSP57053 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
H2BFSP57053 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H2BFSP57053 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
H2BFSP57053 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms