Protein–RNA interactions for Protein: P56750

CLDN17, Claudin-17, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN17P56750 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms