Protein–RNA interactions for Protein: P55145

MANF, Mesencephalic astrocyte-derived neurotrophic factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MANFP55145 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MANFP55145 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MANFP55145 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MANFP55145 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MANFP55145 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MANFP55145 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MANFP55145 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MANFP55145 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MANFP55145 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MANFP55145 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MANFP55145 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MANFP55145 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MANFP55145 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MANFP55145 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MANFP55145 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MANFP55145 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MANFP55145 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MANFP55145 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
MANFP55145 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MANFP55145 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MANFP55145 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MANFP55145 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MANFP55145 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MANFP55145 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MANFP55145 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MANFP55145 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MANFP55145 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MANFP55145 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MANFP55145 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
MANFP55145 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MANFP55145 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
MANFP55145 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
MANFP55145 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
MANFP55145 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MANFP55145 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MANFP55145 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MANFP55145 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MANFP55145 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MANFP55145 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MANFP55145 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MANFP55145 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MANFP55145 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MANFP55145 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MANFP55145 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MANFP55145 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MANFP55145 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MANFP55145 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MANFP55145 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
MANFP55145 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MANFP55145 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MANFP55145 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MANFP55145 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MANFP55145 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MANFP55145 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MANFP55145 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MANFP55145 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MANFP55145 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MANFP55145 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MANFP55145 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MANFP55145 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MANFP55145 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MANFP55145 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
MANFP55145 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
MANFP55145 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MANFP55145 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MANFP55145 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MANFP55145 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MANFP55145 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MANFP55145 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MANFP55145 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MANFP55145 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MANFP55145 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MANFP55145 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MANFP55145 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MANFP55145 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MANFP55145 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MANFP55145 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MANFP55145 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MANFP55145 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MANFP55145 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MANFP55145 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MANFP55145 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MANFP55145 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MANFP55145 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MANFP55145 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MANFP55145 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MANFP55145 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MANFP55145 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MANFP55145 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MANFP55145 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MANFP55145 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MANFP55145 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MANFP55145 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MANFP55145 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MANFP55145 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MANFP55145 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MANFP55145 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MANFP55145 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MANFP55145 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MANFP55145 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms